RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		H3BMQ9	156 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LAD1	O00515	517 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PFDN6	O15212	129 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAPK13	O15264	365 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAP3K7	O43318	606 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATE1	O95260	518 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	VNN1	O95497	513 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CRTAM	O95727	393 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FTCD	O95954	541 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GAS8	O95995	478 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CD9	P21926	228 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTPN7	P35236	360 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RCVRN	P35243	200 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHKB	Q93100	1093 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACD	Q96AP0	544 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	COG8	Q96MW5	612 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	POTEC	B2RU33	542 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159		H3BSA7	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PODXL	O00592	558 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDC80	O14777	642 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEC14L2	O76054	403 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSPA6	P17066	643 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLCNKB	P51801	687 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDST2	P52849	883 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	GALK2	Q01415	458 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTK2	Q05397	1052 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	TBCC	Q15814	346 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSMD5	Q16401	504 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	KYNU	Q16719	465 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	INSC	Q1MX18	579 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	CSF3R	Q99062	836 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PEX2	P28328	305 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	SERPINB3	P29508	390 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	PCK1	P35558	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	FOLH1	Q04609	750 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	STRN3	Q13033	797 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAZ	Q16635	292 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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