RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491659.5

USP39-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 3

Gene USP39, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-217ENST00000491659 EHD2Q9NZN4 543 aa16.09■□□□□ 0.17
USP39-217ENST00000491659 NME7Q9Y5B8 376 aa16.09■□□□□ 0.17
USP39-217ENST00000491659 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.09■□□□□ 0.17
USP39-217ENST00000491659 ATP8B3O60423 1300 aa16.09■□□□□ 0.17
USP39-217ENST00000491659 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.09■□□□□ 0.17
USP39-217ENST00000491659 SOBPA7XYQ1 873 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MAN2B1O00754 1011 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 CETN3O15182 167 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 NCAM2O15394 837 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PRAMEF12O95522 483 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 HLA-DRAP01903 254 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PRCPP42785 496 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 CDH8P55286 799 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 STIM1Q13586 685 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ANGPT1Q15389 498 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TNIP3Q96KP6 325 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 SPATA17Q96L03 361 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 NELL2Q99435 816 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 BCO2Q9BYV7 579 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.08■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 FAM170BA6NMN3 283 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TADA3O75528 432 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 CD72P21854 359 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MAGEA9P43362 315 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 GCLMP48507 274 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TXNDC8Q6A555 127 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 SPATA20Q8TB22 786 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MSANTD3Q96H12 275 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MYH10P35580 1976 aa16.07■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 F8VP50 259 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ARNTLO00327 626 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 STX10O60499 249 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 GLULP15104 373 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PPP1R2P41236 205 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MRE11P49959 708 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PLCB2Q00722 1185 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 LRRC63Q05C16 580 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PPP3CAQ08209 521 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MON1AQ86VX9 555 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 C8orf48Q96LL4 319 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MED10Q9BTT4 135 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 SDCBP2Q9H190 292 aa16.06■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MYO16Q9Y6X6 1858 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PSMA7O14818 248 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 LRRN2O75325 713 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 CKMP06732 381 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 USP17L7P0C7H9 530 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 GTF2H1P32780 548 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ASPAP45381 313 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MXI1P50539 228 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PDE6CP51160 858 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 KRT39Q6A163 491 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 FAM35AQ86V20 835 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 UNC93AQ86WB7 457 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ADSSL1Q8N142 457 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 FAM3CQ92520 227 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 PHOX2BQ99453 314 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TDP1Q9NUW8 608 aa16.05■□□□□ 0.16
USP39-217ENST00000491659 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms