RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486667.5

SRSF11-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 11, human

TSL 5

Gene SRSF11, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF11-215	ENST00000486667	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	DDHD2	O94830	711 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CLTB	P09497	229 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PDE4C	Q08493	712 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ABI1	Q8IZP0	508 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	FUK	Q8N0W3	1084 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	TSC1	Q92574	1164 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	KRT35	Q92764	455 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	MCEE	Q96PE7	176 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	SYT15	Q9BQS2	421 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	SYN3	O14994	580 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	KIAA0355	O15063	1070 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	HCRT	O43612	131 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ATP2C2	O75185	946 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	OAZ2	O95190	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CCDC130	P13994	396 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	NPR3	P17342	541 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	MCM3	P25205	808 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CYP2C18	P33260	490 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	DNA2	P51530	1060 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CCL23	P55773	120 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	IKBKE	Q14164	716 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PTPRO	Q16827	1216 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	SCLY	Q96I15	445 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CNPY3	Q9BT09	278 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ST7	Q9NRC1	585 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	VWA8	A3KMH1	1905 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	DPYSL4	O14531	572 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	B4GALT3	O60512	393 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	EFCAB14	O75071	495 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	GABBR2	O75899	941 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	TIMP1	P01033	207 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	FGG	P02679	453 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ALDH2	P05091	517 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	PYGM	P11217	842 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ADORA2B	P29275	332 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	BRCC3	P46736	316 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	COPS2	P61201	443 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	OGDH	Q02218	1023 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SRSF11-215	ENST00000486667	WDR93	Q6P2C0	686 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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