RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484913.5

PEX1-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 1, human

TSL 2

Gene PEX1, Length 4,051 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX1-208	ENST00000484913		Q9Y3F1	56 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SGK1	O00141	431 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	RARA	P10276	462 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SDC4	P31431	198 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PTGES	O14684	152 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PRLR	P16471	622 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	AP1G2	O75843	785 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	FLT3	P36888	993 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	METTL23	Q86XA0	190 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ECEL1	O95672	775 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CKB	P12277	381 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	EDEM1	Q92611	657 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	TNIP3	Q96KP6	325 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CYP3A5	P20815	502 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	KRT17	Q04695	432 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	JAML	Q86YT9	394 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913		H7C0C1	242 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CREB3	O43889	395 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	TADA2A	O75478	443 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CD48	P09326	243 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PAEP	P09466	180 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	BDNF	P23560	247 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ATP5O	P48047	213 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	NDUFV1	P49821	464 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ADAM17	P78536	824 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	NENF	Q9UMX5	172 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ITGB1	P05556	798 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CYP2C18	P33260	490 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CCDC188	H7C350	402 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CST8	O60676	142 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	GPD1	P21695	349 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	ZNF132	P52740	706 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	CNGA2	Q16280	664 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PEX1-208	ENST00000484913	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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