RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 CCDC192P0DO97 292 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FCARP24071 287 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 GPR158Q5T848 1215 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 SPATA17Q96L03 361 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MED10Q9BTT4 135 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 DACH1Q9UI36 760 aa22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 F8VP50 259 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CLDN5O00501 218 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 NLRP12P59046 1061 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FAM35AQ86V20 835 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MYRFLQ96LU7 910 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.12■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MBD3O95983 291 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 COL4A2P08572 1712 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CILPO75339 1184 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CCDC130P13994 396 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CACNA2D1P54289 1103 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CETN1Q12798 172 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TTC39CQ8N584 583 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 C8orf48Q96LL4 319 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TWNKQ96RR1 684 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ARID3AQ99856 593 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TASP1Q9H6P5 420 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 KRT82Q9NSB4 513 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 EHD2Q9NZN4 543 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 F11P03951 625 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FUKQ8N0W3 1084 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TATDN2Q93075 761 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MED15Q96RN5 788 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CISHQ9NSE2 258 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 WNT16Q9UBV4 365 aa22.1■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 PMM2O15305 246 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 P4HA2O15460 535 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TADA3O75528 432 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 GPC5P78333 572 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 KCNH2Q12809 1159 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 VITQ6UXI7 678 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 SIX5Q8N196 739 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FBXL6Q8N531 539 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 C12orf29Q8N999 325 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 E2F7Q96AV8 911 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CA14Q9ULX7 337 aa22.09■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 VIPR2P41587 438 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 LRMPQ12912 555 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CUL2Q13617 745 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 GRM2Q14416 872 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZNF394Q53GI3 561 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 WHAMMQ8TF30 809 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.08■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.08■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 AP1G2O75843 785 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 USP46P62068 366 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 PFKPQ01813 784 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 NT5C1BQ96P26 610 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.07■■□□□ 1.12
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.07■■□□□ 1.12
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