RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 VWA3BQ502W6 1294 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 STPG3Q8N7X2 389 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 PIGBQ92521 554 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 DPH1Q9BZG8 443 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TLR9Q9NR96 1032 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 BCORQ6W2J9 1755 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TISP43B9A030 160 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 B9A039 149 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SYT5O00445 386 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 MT-ND5P03915 603 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 CKMT1AP12532 417 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FPR1P21462 350 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 RXRGP48443 463 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGA1P56199 1179 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 MPP1Q00013 466 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXO1Q12778 655 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 MTM1Q13496 603 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SPARCL1Q14515 664 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD2Q14681 263 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF385BQ569K4 471 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 RETSATQ6NUM9 610 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 RFX8Q6ZV50 586 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 MICU3Q86XE3 530 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 REPS2Q8NFH8 660 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 OR7D4Q8NG98 312 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 STON2Q8WXE9 905 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 IQCDQ96DY2 449 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX22Q96L94 193 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR92Q96MX6 357 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 BCO1Q9HAY6 547 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 KCND1Q9NSA2 647 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GTL3 188 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM234BA2RU67 622 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 RFXAPO00287 272 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FFAR3O14843 346 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FSBPO95073 299 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TM4SF1P30408 202 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 GUCY1A2P33402 732 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP3K12Q12852 859 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 Q7L0L9 218 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 FANCBQ8NB91 859 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 STYXQ8WUJ0 223 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF480Q8WV37 535 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 TOX2Q96NM4 488 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADBP1-201ENST00000478954 BTN3A1O00481 513 aa6.48□□□□□ -1.37
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