RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 KCNB1Q14721 858 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PDGFRLQ15198 375 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CPA6Q8N4T0 437 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 RIN3Q8TB24 985 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 EXOC4Q96A65 974 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC22A12Q96S37 553 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SNX25Q9H3E2 840 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATG13O75143 517 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 YEATS4O95619 227 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 EGFP01133 1207 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TGM1P22735 817 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 HOXD13P35453 343 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM171BQ6P995 826 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SHC4Q6S5L8 630 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MYRFLQ96LU7 910 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa25.43■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 C2orf78A6NCI8 922 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 RNF40O75150 1001 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CASP1P29466 404 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TNNC1P63316 161 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PSMD2Q13200 908 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR6B3Q8NGW1 331 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHFRQ96EP1 664 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CRTAC1Q9NQ79 661 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.42■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC192P0DO97 292 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 HDCP19113 662 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 WARSP23381 471 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAGEA11P43364 429 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 GALK1P51570 392 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ECT2Q9H8V3 914 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TGFB1I1O43294 461 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABL1P00519 1130 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 DRD1P21728 446 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 GJA4P35212 333 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 AFMP43652 599 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ME1P48163 572 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRPC3Q13507 836 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF77Q15935 545 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 VSTM1Q6UX27 236 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATP2A3Q93084 1043 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PCED1BQ96HM7 432 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CGRRF1Q99675 332 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 RTKNQ9BST9 563 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.4■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 UBE4BO95155 1302 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PHACTR2O75167 634 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYP24A1Q07973 514 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 NR1H3Q13133 447 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PSMD6Q15008 389 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 WDR72Q3MJ13 1102 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 UNC13DQ70J99 1090 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 GPR179Q6PRD1 2367 aa25.39■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRIM66O15016 1216 aa25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 AXIN1O15169 862 aa25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 LRP3O75074 770 aa25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 HOXA6P31267 233 aa25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 PDE6CP51160 858 aa25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 USP4Q13107 963 aa25.38■■□□□ 1.65
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms