RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GAD1Q99259 594 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ISCUQ9H1K1 167 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SNX25Q9H3E2 840 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CISHQ9NSE2 258 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SIX4Q9UIU6 781 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NAGPAQ9UK23 515 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 FGF18O76093 207 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 TYMPP19971 482 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PCSK1P29120 753 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GNA15P30679 374 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PRSS12P56730 875 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ERVFC1P60507 584 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GPC5P78333 572 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 INCA1Q0VD86 236 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SMARCB1Q12824 385 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CXorf38Q8TB03 319 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 APOL6Q9BWW8 343 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GPR88Q9GZN0 384 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 S1PR5Q9H228 398 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CYLDQ9NQC7 956 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 LZTS1Q9Y250 596 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NR2E1Q9Y466 385 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 A0A087X0T9 212 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PODXLO00592 558 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 FSCN2O14926 492 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SYN3O14994 580 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 LRRN2O75325 713 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CILPO75339 1184 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CYP11A1P05108 521 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CALB1P05937 261 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 WEE2P0C1S8 567 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM253P0C7T8 217 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 FAM228BP0C875 321 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SETSIPP0DME0 302 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 TNNT1P13805 278 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PRLRP16471 622 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 DESP17661 470 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 LAG3P18627 525 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 CASQ1P31415 396 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NBL1P41271 181 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGAP25P42331 645 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ASPAP45381 313 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GATMP50440 423 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF132P52740 706 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 WNT7BP56706 349 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 PLCB3Q01970 1234 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 MTMR3Q13615 1198 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 KCNC3Q14003 757 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 UPP1Q16831 310 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 SGO2Q562F6 1265 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 GJB7Q6PEY0 223 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-207ENST00000475558 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms