RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089		F8VP50	259 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	STX10	O60499	249 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TADA3	O75528	432 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	PSMC3	P17980	439 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ANXA13	P27216	316 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	GDI1	P31150	447 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CLCN5	P51795	746 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	STX17	P56962	302 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TTI2	Q6NXR4	508 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TNIP3	Q96KP6	325 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MYRFL	Q96LU7	910 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	BCO2	Q9BYV7	579 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM66	O15016	1216 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	PRAMEF12	O95522	483 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CBWD6	Q4V339	395 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA17	Q96L03	361 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MED10	Q9BTT4	135 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MYH10	P35580	1976 aa		31.17	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	AOC1	P19801	751 aa		31.16	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TXNDC8	Q6A555	127 aa		31.16	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	PRSS33	Q8NF86	280 aa		31.16	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	E2F7	Q96AV8	911 aa		31.16	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		31.16	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB20	Q9NX57	234 aa		31.16	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		31.16	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	BICDL2	A1A5D9	508 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	DPYSL4	O14531	572 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CD58	P19256	250 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	USP46	P62068	366 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	PAK1	Q13153	545 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM35A	Q86V20	835 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	C8orf48	Q96LL4	319 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP63	Q96MT8	703 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXQ1	Q9C009	403 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNH6	Q9H252	994 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC130	P13994	396 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	UNC93A	Q86WB7	457 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	YAF2	Q8IY57	180 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC35C1	Q96A29	364 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TWNK	Q96RR1	684 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	COL4A2	P08572	1712 aa		31.14	■■■□□ 2.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF263	O14978	683 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	STARD6	P59095	220 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	INCA1	Q0VD86	236 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	C12orf29	Q8N999	325 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	IRF7	Q92985	503 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	SHD	Q96IW2	340 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP8B3	O60423	1300 aa		31.13	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	CD72	P21854	359 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	WEE1	P30291	646 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	AVPR1A	P37288	418 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	PRKCQ	Q04759	706 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	MON1A	Q86VX9	555 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	FUK	Q8N0W3	1084 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	DNASE1L2	Q92874	299 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	TATDN2	Q93075	761 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNK16	Q96T55	309 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		31.12	■■■□□ 2.57
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR44	Q5JSH3	913 aa		31.11	■■■□□ 2.57

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