RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 RECKO95980 971 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 LPLP06858 475 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CD6P30203 668 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 IGFALSP35858 605 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 BFSP2Q13515 415 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SEC23BQ15437 767 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ODF3L2Q3SX64 289 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 MTERF2Q49AM1 385 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 PP632Q6XCG6 107 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 TMIEQ8NEW7 156 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 IMPG2Q9BZV3 1241 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SMOC2Q9H3U7 446 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 MS4A5Q9H3V2 200 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 DECR2Q9NUI1 292 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 PRO0461Q9UI25 63 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa1.63□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 TGM5O43548 720 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 GCATO75600 419 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 FESP07332 822 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 LMO4P61968 165 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SHBQ15464 509 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf57Q5W0N0 161 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 WBP2NLQ6ICG8 309 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SLC30A10Q6XR72 485 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM199Q8N511 208 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF610Q8N9Z0 462 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 HERPUD2Q9BSE4 406 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CDT1Q9H211 546 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ASIC5Q9NY37 505 aa1.62□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 AMY1AP04745 511 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 KCNJ4P48050 445 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF793Q6ZN11 406 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CYFIP2Q96F07 1278 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC17Q96LX7 622 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SCOCQ9UIL1 159 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 KCNG1Q9UIX4 513 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CROCCQ5TZA2 2017 aa1.61□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF814B7Z6K7 855 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 PDPK1O15530 556 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CPA2P48052 419 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SLC6A9P48067 706 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ATP8B2P98198 1209 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 PTGR1Q14914 329 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ATP2B3Q16720 1220 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ANO6Q4KMQ2 910 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 MTHFD1LQ6UB35 978 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 C16orf82Q7Z2V1 217 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ARMC9Q7Z3E5 817 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SLC17A8Q8NDX2 589 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ORAI3Q9BRQ5 295 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 EDARQ9UNE0 448 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 NFS1Q9Y697 457 aa1.6□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 BMPR1BO00238 502 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 SOAT2O75908 522 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 ENDOD1O94919 500 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 FGRP09769 529 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 DDCP20711 480 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 LPOP22079 712 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 FPR3P25089 353 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC27Q2M243 656 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 AWAT1Q58HT5 328 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 FRMD7Q6ZUT3 714 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CCHCR1Q8TD31 782 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 EGFL8Q99944 293 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 RETREG1Q9H6L5 497 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 JKAMPQ9P055 326 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 IGSF9Q9P2J2 1179 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 MYO6Q9UM54 1294 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHA12Q9UN75 941 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 COG5Q9UP83 839 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 MSRB2Q9Y3D2 182 aa1.59□□□□□ -2.15
SHQ1-204ENST00000468347 CLEC18AA5D8T8 446 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 E9PLN8 166 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 SLC16A5O15375 505 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 CFC1BP0CG36 223 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 CFC1P0CG37 223 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 ITGALP20701 1170 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 ATP12AP54707 1039 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 TPTEP56180 551 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 PPP3CAQ08209 521 aa1.58□□□□□ -2.16
SHQ1-204ENST00000468347 STIM1Q13586 685 aa1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms