RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ASPAP45381 313 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 STARD6P59095 220 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 PRKCQQ04759 706 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 MORC3Q14149 939 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 DNASE1L2Q92874 299 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 IRF7Q92985 503 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 NCANO14594 1321 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF263O14978 683 aa25.52■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 WEE1P30291 646 aa25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 MXI1P50539 228 aa25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 TXNDC8Q6A555 127 aa25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.52■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF12O95522 483 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 AVPR1AP37288 418 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 NDST1P52848 882 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN5P54829 565 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 ACOT1Q86TX2 421 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 C8orf48Q96LL4 319 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 MED10Q9BTT4 135 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 BCO2Q9BYV7 579 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 FOXQ1Q9C009 403 aa25.51■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 HEBP1Q9NRV9 189 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 OBP2AQ9NY56 170 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 SIT1Q9Y3P8 196 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 ATP8B3O60423 1300 aa25.51■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRDP23468 1912 aa25.51■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 TCF15Q12870 199 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 ORC1Q13415 861 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CAMK4Q16566 473 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 TPRG1Q6ZUI0 275 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 MON1AQ86VX9 555 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 UNC93AQ86WB7 457 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 NELFBQ8WX92 580 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.5■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.5■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 LRRC3BQ96PB8 259 aa25.49■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 TRPC7Q9HCX4 862 aa25.49■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 TRPV5Q9NQA5 729 aa25.49■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 EHD2Q9NZN4 543 aa25.49■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.49■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.49■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.49■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 BICDL2A1A5D9 508 aa25.48■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CD72P21854 359 aa25.48■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 NHLH1Q02575 133 aa25.48■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 UBXN2BQ14CS0 331 aa25.48■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 CCDC105Q8IYK2 499 aa25.48■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25.48■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 PJA1Q8NG27 643 aa25.48■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.48■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
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SMKR1-201ENST00000462322 CD58P19256 250 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 INCA1Q0VD86 236 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CBWD6Q4V339 395 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 WDR44Q5JSH3 913 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 TTI2Q6NXR4 508 aa25.47■■□□□ 1.67
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF852Q6ZMS4 543 aa25.47■■□□□ 1.67
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