RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SSTR1P30872 391 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 37.7
IMP4-208ENST00000460766 E2F5Q15329 346 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TAF5Q15542 800 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CALN1Q9BXU9 219 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.48■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 IRF6O14896 467 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 IL18RAPO95256 599 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 IQCF3P0C7M6 154 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MSS51Q4VC12 460 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RNF43Q68DV7 783 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 OTUD5Q96G74 571 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 WDR90Q96KV7 1748 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 CLUHO75153 1309 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 M0QYV0 167 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SLC8A1P32418 973 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PHBP35232 272 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 IGBP1P78318 339 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 JADE1Q6IE81 842 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 LACTBL1A8MY62 500 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 GPR25O00155 361 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RNF8O76064 485 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MICAL2O94851 1124 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MIPP30301 263 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 WDR78Q5VTH9 848 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ELP3Q9H9T3 547 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PPCSQ9HAB8 311 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 KRT4P19013 534 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ACVR2BQ13705 512 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SLC1A5Q15758 541 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 EFHC2Q5JST6 749 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 FGD4Q96M96 766 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
IMP4-208ENST00000460766 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CNMDO75829 334 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 STAG3L1P0CL83 205 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SLC18A1P54219 525 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 BASP1P80723 227 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 HHATQ5VTY9 493 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 USP18Q9UMW8 372 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MAGEB2O15479 319 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PDK4Q16654 411 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 BBS9Q3SYG4 887 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 FBF1Q8TES7 1133 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PIK3R2O00459 728 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MCF2LO15068 1137 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 TYROBPO43914 113 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 HBP1O60381 514 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CILPO75339 1184 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 TMEM63AO94886 807 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 NRLP54845 237 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 KCTD2Q14681 263 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 TAZQ16635 292 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PALM2Q8IXS6 379 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 GPC2Q8N158 579 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 UBA3Q8TBC4 463 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
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