RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCB6Q9NP58 842 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 AMHP03971 560 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 CALB1P05937 261 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 MS4A14Q96JA4 679 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 SNX12Q9UMY4 172 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 MAP3K7CLP57077 242 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 MYLPFQ96A32 169 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.125e-10■■■□□ 15.1
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SH3BP2-204ENST00000452765 CDH9Q9ULB4 789 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 MTA2O94776 668 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 CBX1P83916 185 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM11Q96F44 468 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 PARVAQ9NVD7 372 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 TCEAL1Q15170 157 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 RTP2Q5QGT7 225 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 NDUFV1P49821 464 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 BCAT1P54687 386 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM35AQ86V20 835 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 DUSP16Q9BY84 665 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 KCNK3O14649 394 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 AP1G2O75843 785 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 TYMPP19971 482 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 GABRB2P47870 512 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 ARPP19P56211 112 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 LLGL1Q15334 1064 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS6KA1Q15418 735 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB6CQ53S08 254 aa22.04■■□□□ 1.12
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