RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 ZFYVE19Q96K21 471 aa29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC3BQ96PB8 259 aa29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 IMPG2Q9BZV3 1241 aa29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 LTB4R2Q9NPC1 389 aa29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 CLDN5O00501 218 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 CETN3O15182 167 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 EPB41P11171 864 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 PPP3CAQ08209 521 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ANGPT1Q15389 498 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TTC8Q8TAM2 541 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 MED10Q9BTT4 135 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 PIAS3Q9Y6X2 628 aa29.55■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 F8VP50 259 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM66O15016 1216 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.327e-8■■■□□ 17.2
FAAP20-210ENST00000440825 ORC1Q13415 861 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 BPIFB1Q8TDL5 484 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 B3GNT5Q9BYG0 378 aa29.54■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 MIA3Q5JRA6 1907 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 CHADO15335 359 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TADA3O75528 432 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ASS1P00966 412 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 GLULP15104 373 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TARSP26639 723 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 MRE11P49959 708 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TAS1R2Q8TE23 839 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TAF4BQ92750 862 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TNIP3Q96KP6 325 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA17Q96L03 361 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 MYRFLQ96LU7 910 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 BCO2Q9BYV7 579 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ZMYM5Q9UJ78 669 aa29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 CACNA2D1P54289 1103 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 FCHO2Q0JRZ9 810 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD40Q6AI12 368 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ACOT1Q86TX2 421 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA20Q8TB22 786 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 OBP2AQ9NY56 170 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 CCL26Q9Y258 94 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 OBSL1O75147 1896 aa29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 DENND4CQ5VZ89 1909 aa29.51■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 ATP8B3O60423 1300 aa29.51■■■□□ 2.32
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM49BA6NDI0 452 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 PMS1P54277 932 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 USP46P62068 366 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 STIM1Q13586 685 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TCERG1LQ5VWI1 586 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 MON1AQ86VX9 555 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC150Q8NCX0 1101 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM8AQ9HCN3 771 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TRPV5Q9NQA5 729 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 HMGXB4Q9UGU5 601 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 PTPRDP23468 1912 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 MAN2B1O00754 1011 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CKMP06732 381 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 WEE1P30291 646 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ASPAP45381 313 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SOX9P48436 509 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 NDST1P52848 882 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 NOP14P78316 857 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ADSSL1Q8N142 457 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 FAM3CQ92520 227 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 C8orf48Q96LL4 319 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CYP2S1Q96SQ9 504 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TDP1Q9NUW8 608 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.5■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ARNTLO00327 626 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 BIN1O00499 593 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 NCAM2O15394 837 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 CCNE1P24864 410 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TNK2Q07912 1038 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 KLHL10Q6JEL2 608 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 NELL2Q99435 816 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM30AQ9NV96 361 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 GTSE1Q9NYZ3 720 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-210ENST00000440825 COL4A2P08572 1712 aa29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms