RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 FZD5Q13467 585 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 KCNB1Q14721 858 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 E2F7Q96AV8 911 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A12Q96S37 553 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 BCO2Q9BYV7 579 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 F8VP50 259 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CHADO15335 359 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ATICP31939 592 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 AVPR1AP37288 418 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PIK3CAP42336 1068 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MAGEA11P43364 429 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZACNQ401N2 412 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 WDR44Q5JSH3 913 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SV2AQ7L0J3 742 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FAM3CQ92520 227 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 EML5Q05BV3 1969 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CFAP54Q96N23 3096 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 C2orf78A6NCI8 922 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 KIF20AO95235 890 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DRAP01903 254 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SP9P0CG40 484 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ANXA13P27216 316 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 GCLMP48507 274 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 VAMP7P51809 220 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 AP3M2P53677 418 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PPP3CAQ08209 521 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ADAM9Q13443 819 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TSSK4Q6SA08 328 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TMC2Q8TDI7 906 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MYRFLQ96LU7 910 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 OBP2AQ9NY56 170 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PRR23AA6NEV1 266 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PROB1E7EW31 1015 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MAN2B1O00754 1011 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 WEE1P30291 646 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 PRCPP42785 496 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ASPAP45381 313 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MTAPQ13126 283 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ISM2Q6H9L7 571 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 VSTM1Q6UX27 236 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 FAM35AQ86V20 835 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MON1AQ86VX9 555 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 CLDN23Q96B33 292 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TDP1Q9NUW8 608 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 TRIM66O15016 1216 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAME-209ENST00000439106 LAMTOR5O43504 91 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms