RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438298.6

TRAF3IP2-AS1-202, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 1,106 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TADA3O75528 432 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 LDHAP00338 332 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ITGB3P05106 788 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 USP17L7P0C7H9 530 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GARTP22102 1010 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 WNT7BP56706 349 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FAM160A1Q05DH4 1040 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KCNA1Q09470 495 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MTF1Q14872 753 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PLK5Q496M5 336 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CFAP221Q4G0U5 840 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SDHAF4Q5VUM1 108 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 USP49Q70CQ1 688 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SYT13Q7L8C5 426 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 STKLD1Q8NE28 680 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 OSCP1Q8WVF1 389 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DNAJC19Q96DA6 116 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PKMYT1Q99640 499 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 VPS45Q9NRW7 570 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RXFP3Q9NSD7 469 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CCDC39Q9UFE4 941 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GTF3C4Q9UKN8 822 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ITGA11Q9UKX5 1188 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ITPR1Q14643 2758 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 THADAQ6YHU6 1953 aa12.76□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MYMKA6NI61 221 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 APBB3O95704 486 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CKMP06732 381 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PCSK1P29120 753 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MPLP40238 635 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 LHX1P48742 406 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RBP5P82980 135 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 USP4Q13107 963 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ELF2Q15723 593 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ZNF77Q15935 545 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SV2BQ7L1I2 683 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CCDC26Q8TAB7 109 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CXorf38Q8TB03 319 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CD101Q93033 1021 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ACDQ96AP0 544 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SAAL1Q96ER3 474 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 HHIPQ96QV1 700 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SLC22A12Q96S37 553 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CYP2S1Q96SQ9 504 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TRPC7Q9HCX4 862 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 OLFML3Q9NRN5 406 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TBC1D7Q9P0N9 293 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 EBF1Q9UH73 591 aa12.75□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ATRXP46100 2492 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PTPRDP23468 1912 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GABRDO14764 452 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RHOBTB1O94844 696 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GCNT3O95395 438 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TCF3P15923 654 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PMLP29590 882 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MAGEA11P43364 429 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 IFNAR2P48551 515 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SHC2P98077 582 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NR1H3Q13133 447 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ALCAMQ13740 583 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DMC1Q14565 340 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 EML3Q32P44 896 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RRAGBQ5VZM2 374 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FAM171BQ6P995 826 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ADGRF2Q8IZF7 708 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FSIP1Q8NA03 581 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GCNT4Q9P109 453 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SIX4Q9UIU6 781 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SNX9Q9Y5X1 595 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 WNT6Q9Y6F9 365 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 LAMA5O15230 3695 aa12.74□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PI4KAP42356 2102 aa12.73□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KRT19P08727 400 aa12.73□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 HDCP19113 662 aa12.73□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TXLNAP40222 546 aa12.73□□□□□ -0.37
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PDE6CP51160 858 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms