RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 CENPCQ03188 943 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMNB2Q03252 620 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAPK6Q16659 721 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 DENND2CQ68D51 928 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTC13Q8NBP0 860 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 AFG1LQ8WV93 481 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEC14L1Q92503 715 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 GLG1Q92896 1179 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 RMDN1Q96DB5 314 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERP44Q9BS26 406 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMACRQ9UHK6 382 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLAAQ9Y263 795 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGPSO00116 658 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMAPO00193 183 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTI1O43156 1089 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 MED7O43513 233 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOM1L1O75674 476 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSPG5O95196 566 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 STBD1O95210 358 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL18RAPO95256 599 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 RB1P06400 928 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLTAP09496 248 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 P4HA1P13674 534 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 GLRA2P23416 452 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 BMPR1AP36894 532 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRPC3Q13507 836 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCOA4Q13772 614 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAMK1Q14012 370 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP1R7Q15435 360 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP1B1Q16678 543 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 JAMLQ86YT9 394 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTC39CQ8N584 583 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM143Q96AN5 459 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCHPQ9BT92 498 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL1A2P08123 1366 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0B4J269 797 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 EBAG9O00559 213 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 OGTO15294 1046 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms