RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNX27Q96L92 541 aa26.55■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINB12Q96P63 405 aa26.55■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNX9Q9Y5X1 595 aa26.55■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 SGK1O00141 431 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CST8O60676 142 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 F2P00734 622 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CD48P09326 243 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP2C9P11712 490 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 MIPP30301 263 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 YARSP54577 528 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCTD6Q8NC69 237 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 KAT2BQ92831 832 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CENPTQ96BT3 561 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 C9orf72Q96LT7 481 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 DERAQ9Y315 318 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 E5RJQ4 531 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC42EP1Q00587 391 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERMARDQ5T6L9 678 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 NOTUMQ6P988 496 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAOK1Q7L7X3 1001 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 RELL1Q8IUW5 271 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC35B2Q8TB61 432 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 HSPH1Q92598 858 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASNSD1Q9NWL6 643 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP18Q9UMW8 372 aa26.54■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM66O15016 1216 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFNB1P01574 187 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CORO7P57737 925 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDE4CQ08493 712 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACAP1Q15027 740 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAF5Q15542 800 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACTL9Q8TC94 416 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 FOXP3Q9BZS1 431 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 PFKMP08237 780 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TLK2Q86UE8 772 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXOC3L1Q86VI1 746 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 C10orf67Q8IYJ2 551 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIP11Q15643 1979 aa26.53■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPD1P21695 349 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAZQ16635 292 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CEP128Q6ZU80 1094 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 BBS12Q6ZW61 710 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACOT1Q86TX2 421 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF19AQ9NV58 838 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa26.52■■□□□ 1.84
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAGEA4P43358 317 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 RGS7P49802 495 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAP2K5Q13163 448 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 MFSD10Q14728 455 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZBTB6Q15916 424 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 MORN1Q5T089 497 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC13Q8NBP0 860 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 BEST2Q8NFU1 509 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCDH9Q9HC56 1237 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 HIC1Q14526 733 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 STILQ15468 1287 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRNP1Q6NT89 227 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 RFX6Q8HWS3 928 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 RXFP2Q8WXD0 754 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 APOL6Q9BWW8 343 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 MIS12Q9H081 205 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 SAYSD1Q9NPB0 183 aa26.51■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRAP2O75791 330 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDGFRAP16234 1089 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCK1P35558 622 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 QPCTQ16769 361 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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