RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433924.5

SLC20A1-204, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 4

Gene SLC20A1, Length 638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-204ENST00000433924 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 PKMYT1Q99640 499 aa13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 EBF3Q9H4W6 596 aa13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 RAB23Q9ULC3 237 aa13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.4□□□□□ -0.26
SLC20A1-204ENST00000433924 TRIM66O15016 1216 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 USP17L7P0C7H9 530 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CHRNB1P11230 501 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 WEE1P30291 646 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MAGEA11P43364 429 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CXCL12P48061 93 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CASP4P49662 377 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MYL6P60660 151 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SATB1Q01826 763 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 FZD5Q13467 585 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ZNF699Q32M78 642 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 DGKKQ5KSL6 1271 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 Q6ZS52 159 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MON1AQ86VX9 555 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 PAGE5Q96GU1 130 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 PCED1BQ96HM7 432 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 GKN1Q9NS71 199 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.39□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 A8MXQ7 604 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 TADA3O75528 432 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ABL1P00519 1130 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SYKP43405 635 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ID4P47928 161 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 IFNAR2P48551 515 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 PDE6CP51160 858 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 RUNX3Q13761 415 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MTF1Q14872 753 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CEP135Q66GS9 1140 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 FAM171BQ6P995 826 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 VSTM1Q6UX27 236 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CPA6Q8N4T0 437 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 DCLK2Q8N568 766 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CHAMP1Q96JM3 812 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MYRFLQ96LU7 910 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 EHD2Q9NZN4 543 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 USP25Q9UHP3 1055 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ATP8B3O60423 1300 aa13.38□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 C2orf78A6NCI8 922 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 F8VP50 259 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 KLRC4O43908 158 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 NR3C1P04150 777 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ARSAP15289 507 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CMA1P23946 247 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 RAP1GAPP47736 663 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 AMPD2Q01433 879 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 STK4Q13043 487 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 PSMD2Q13200 908 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 LPAL2Q16609 132 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ZNF667Q5HYK9 610 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SUMF1Q8NBK3 374 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SLC22A12Q96S37 553 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CYP2S1Q96SQ9 504 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MED10Q9BTT4 135 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 ELOVL4Q9GZR5 314 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 EPC1Q9H2F5 836 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 HPS4Q9NQG7 708 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa13.37□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 SOBPA7XYQ1 873 aa13.36□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 TACC1O75410 805 aa13.36□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 KIF20AO95235 890 aa13.36□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 MYL1P05976 194 aa13.36□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SLC20A1-204ENST00000433924 HDCP19113 662 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms