RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429990.1

NPIPB15-201, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NPIPB15, Length 1,428 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15-201ENST00000429990 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 UNC93AQ86WB7 457 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 MLKLQ8NB16 471 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 MYADMQ96S97 322 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 PKMYT1Q99640 499 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 SYT15Q9BQS2 421 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 CEP72Q9P209 647 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 MYH10P35580 1976 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 FRYLO94915 3013 aa7.6□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 TMEM221A6NGB7 291 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 POM121CA8CG34 1229 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 A8MXQ7 604 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 M0R296 226 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 P4HA2O15460 535 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 ECI2O75521 394 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 VNN1O95497 513 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 HLA-DRAP01903 254 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 SRFP11831 508 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 ANXA13P27216 316 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 PPP3CCP48454 512 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 GCLMP48507 274 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 PDE6CP51160 858 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 DLG4P78352 724 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 PFKPQ01813 784 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 INCA1Q0VD86 236 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 MMRN1Q13201 1228 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 WDR44Q5JSH3 913 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 TTI2Q6NXR4 508 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 ITFG1Q8TB96 612 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 NELFBQ8WX92 580 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 SMARCD2Q92925 531 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 SPATA17Q96L03 361 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 MYRFLQ96LU7 910 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 TMEM209Q96SK2 561 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 KCNH6Q9H252 994 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 RAB20Q9NX57 234 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.59□□□□□ -1.19
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 MBD3O95983 291 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 ASGR2P07307 311 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 TRIM49P0CI25 452 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 TRIM49CP0CI26 452 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 CCDC192P0DO97 292 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 MYL4P12829 197 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 PFKLP17858 780 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 ATF6P18850 670 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 BMP6P22004 513 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 LMO2P25791 158 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 NTHL1P78549 312 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 CYP27A1Q02318 531 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 PPP3CAQ08209 521 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 PTPRNQ16849 979 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.58□□□□□ -1.2
NPIPB15-201ENST00000429990 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms