RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	ASGR2	P07307	311 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP2F1	P24903	491 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CCR2	P41597	374 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PARM1	Q6UWI2	310 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NDST1	P52848	882 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ING5	Q8WYH8	240 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	IRF7	Q92985	503 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MED10	Q9BTT4	135 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	BIN1	O00499	593 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DPYSL4	O14531	572 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PSMC3	P17980	439 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TUB	P50607	506 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	STIL	Q15468	1287 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NELL2	Q99435	816 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160		A0A1W2PRU2	124 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CHAD	O15335	359 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	BDNF	P23560	247 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	STARD6	P59095	220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CAMK4	Q16566	473 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP2C2	O75185	946 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PAEP	P09466	180 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CUL2	Q13617	745 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FGF14	Q92915	247 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.68	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF263	O14978	683 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SOAT2	O75908	522 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC8A3	P57103	927 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GCNT1	Q02742	428 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MEA1	Q16626	185 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DDR2	Q16832	855 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.67	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	UBR7	Q8N806	425 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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