RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 TNIP3Q96KP6 325 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 HINFPQ9BQA5 517 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 HESX1Q9UBX0 185 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ADORA2BP29275 332 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TCTN1Q2MV58 587 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TRIM60Q495X7 471 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 FUKQ8N0W3 1084 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 EMC1Q8N766 993 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SCN5AQ14524 2016 aa22.09■■□□□ 1.13
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GPC1-202ENST00000420138 RAD51CO43502 376 aa22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 B3GAT3O94766 335 aa22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 GLI1P08151 1106 aa22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TRNP1Q6NT89 227 aa22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.08■■□□□ 1.13
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GPC1-202ENST00000420138 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
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GPC1-202ENST00000420138 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 STIM2Q9P246 746 aa22.08■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 TLE2Q04725 743 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CLUL1Q15846 466 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 MAP9Q49MG5 647 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PRELID2Q8N945 189 aa22.08■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.08■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 F8W810 466 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 I3L4J1 428 aa22.07■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 BCAT1P54687 386 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 DSC1Q08554 894 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 FAAP100Q0VG06 881 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 LRRC38Q5VT99 294 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 FSCN2O14926 492 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PSMA2P25787 234 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 LHX1P48742 406 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 MIS12Q9H081 205 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 HIPK3Q9H422 1215 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.06■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 CYP11A1P05108 521 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TAF5Q15542 800 aa22.06■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 GDF3Q9NR23 364 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 RARAP10276 462 aa22.05■■□□□ 1.12
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