RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf48Q96LL4 319 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MYRFLQ96LU7 910 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MED10Q9BTT4 135 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CA14Q9ULX7 337 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 F8VP50 259 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CD58P19256 250 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 FMO5P49326 533 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNA2D1P54289 1103 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 INCA1Q0VD86 236 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf29Q8N999 325 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 GPT2Q8TD30 523 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 E2F7Q96AV8 911 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 KRBA1A5PL33 1030 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMC3P17980 439 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 WEE1P30291 646 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 GRM2Q14416 872 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 VITQ6UXI7 678 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 FUKQ8N0W3 1084 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 WHAMMQ8TF30 809 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MED15Q96RN5 788 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TWNKQ96RR1 684 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNK16Q96T55 309 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP8B3O60423 1300 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PMM2O15305 246 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CILPO75339 1184 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 NPR3P17342 541 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 AVPR2P30518 371 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 USP46P62068 366 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PFKPQ01813 784 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNDC8Q6A555 127 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM35AQ86V20 835 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 FLCNQ8NFG4 579 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 EHD2Q9NZN4 543 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SOBPA7XYQ1 873 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 STK25O00506 426 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 DPYSL4O14531 572 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC192P0DO97 292 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC130P13994 396 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CETN1Q12798 172 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH2Q12809 1159 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 LRMPQ12912 555 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 IER5LQ5T953 404 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MON1AQ86VX9 555 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC39CQ8N584 583 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 BRD9Q9H8M2 597 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CISHQ9NSE2 258 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 P4HA2O15460 535 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TADA3O75528 432 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 AP1G2O75843 785 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 GDI1P31150 447 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF394Q53GI3 561 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP93Q8N1F7 819 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ARID3AQ99856 593 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-204ENST00000416021 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.4■■□□□ 1.18
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