RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ASIC4Q96FT7 647 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CPB2Q96IY4 423 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 PBKQ96KB5 322 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 SNX27Q96L92 541 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ACAP3Q96P50 834 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 RNF186Q9NXI6 227 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CNTN3Q9P232 1028 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 SRRDQ9UH36 339 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 COG5Q9UP83 839 aa6.42□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ANK1P16157 1881 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 NCK2O43639 380 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 FTCDO95954 541 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 PAEPP09466 180 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 RARBP10826 455 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 KRT5P13647 590 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 KCNE1P15382 129 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 OSTNP61366 133 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 NOMO3P69849 1222 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 MGAT3Q09327 533 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 INCA1Q0VD86 236 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TRPC3Q13507 836 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 RPS6KA1Q15418 735 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF699Q32M78 642 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TAF3Q5VWG9 929 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM270Q6UE05 265 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 MON1BQ7L1V2 547 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 SERINC5Q86VE9 423 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 C7orf31Q8N865 590 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 RUBCNQ92622 972 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CD101Q93033 1021 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 OSMRQ99650 979 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 LHX5Q9H2C1 402 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 SPC25Q9HBM1 224 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CISHQ9NSE2 258 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 GRIN2DO15399 1336 aa6.41□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CILPO75339 1184 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CABYRO75952 493 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.383e-7■■■□□ 14.8
C6orf48-208ENST00000395788 NPTXRO95502 500 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 PGK1P00558 417 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 HMGCRP04035 888 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ITGB3P05106 788 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CYP3A5P20815 502 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 ABCB4P21439 1286 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 FGFR4P22455 802 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 HOXD10P28358 340 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 GNA15P30679 374 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 PEX5P50542 639 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 RAD23BP54727 409 aa6.4□□□□□ -1.38
C6orf48-208ENST00000395788 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms