RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TADA3O75528 432 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ISM2Q6H9L7 571 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA17Q96L03 361 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 PHOX2BQ99453 314 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TSG101Q99816 390 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 OBP2AQ9NY56 170 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM170BA6NMN3 283 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 F8VP50 259 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDN5O00501 218 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM66O15016 1216 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CHADO15335 359 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 GLULP15104 373 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 AVPR1AP37288 418 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MON1AQ86VX9 555 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ADSSL1Q8N142 457 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ARNTLO00327 626 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ASPAP45381 313 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNA2D1P54289 1103 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ANGPT1Q15389 498 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TNIP3Q96KP6 325 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 C8orf48Q96LL4 319 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 SHISA7A6NL88 538 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 SOBPA7XYQ1 873 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF2H1P32780 548 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 USP46P62068 366 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 STIM1Q13586 685 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT39Q6A163 491 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ACOT1Q86TX2 421 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 NELL2Q99435 816 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MED10Q9BTT4 135 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL26Q9Y258 94 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH10P35580 1976 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MAN2B1O00754 1011 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMA7O14818 248 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 NDST1P52848 882 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC63Q05C16 580 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ORC1Q13415 861 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 BCO2Q9BYV7 579 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TDP1Q9NUW8 608 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 EHD2Q9NZN4 543 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNA1HO95180 2353 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP8B3O60423 1300 aa21.52■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 STX10O60499 249 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms