RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFS2O75306 463 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GNAI2P04899 355 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTA2P09210 222 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CCND1P24385 295 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP1A2P50993 1020 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 OLR1P78380 273 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP4P98171 946 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ASPHQ12797 758 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ERV3-1Q14264 604 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNJ12Q14500 433 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GANCQ8TET4 914 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 OTUD5Q96G74 571 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MNTQ99583 582 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FANCLQ9NW38 375 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 JAG2Q9Y219 1238 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SYCE1LA8MT33 242 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 LILRB5O75023 590 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CD46P15529 392 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF2A2P52657 109 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IFITM2Q01629 132 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PPARDQ03181 441 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RBL2Q08999 1139 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SERINC3Q13530 473 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EXOC2Q96KP1 924 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FSD1Q9BTV5 496 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PARP2Q9UGN5 583 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DMTF1Q9Y222 760 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00587B1AMM8 73 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PIAS2O75928 621 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EOMESO95936 686 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8K3Q8NH51 312 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GIPC3Q8TF64 312 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 BSNDQ8WZ55 320 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TBATAQ96M53 351 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 S100A14Q9HCY8 104 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIP5K2O43314 1243 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GPC4O75487 556 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GH2P01242 217 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 M6PRP20645 277 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCR2P25025 360 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FANCCQ00597 558 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCY1A3Q02108 690 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DSC1Q08554 894 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SGO2Q562F6 1265 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SGO1Q5FBB7 561 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM171BQ6P995 826 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ITPKCQ96DU7 683 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS16Q9H269 839 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IL25Q9H293 177 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT86O43790 486 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GRIN3BO60391 1043 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms