RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCEAL3Q969E4 200 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAAL1Q96ER3 474 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 EDEM2Q9BV94 578 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 HPSEQ9Y251 543 aa20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A1W2PQD8 194 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CSH1P0DML2 217 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSH2P0DML3 217 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJA4P35212 333 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 EHHADHQ08426 723 aa20.57■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-204ENST00000373166 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 FSIP1Q8NA03 581 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACDQ96AP0 544 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 EXOC1Q9NV70 894 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-204ENST00000373166 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-204ENST00000373166 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 SV2CQ496J9 727 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPD1LQ8N335 351 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD101Q93033 1021 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 ECT2Q9H8V3 914 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 GBP1P32455 592 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 DGKEP52429 567 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSMD2Q13200 908 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTF1Q14872 753 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 C11orf74Q86VG3 221 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIN3Q8TB24 985 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP2A3Q93084 1043 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFNAR2P48551 515 aa20.54■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC16Q8NEE8 873 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 CACNA1GO43497 2377 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 LNP1A1A4G5 178 aa20.53■□□□□ 0.88
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