RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISM1B1AKI9 464 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MGEA5O60502 916 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROP1O75360 226 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1QL1O75973 258 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED1O96006 694 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FESP07332 822 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD38P28907 300 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIPAP38571 399 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH9A1P49189 494 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE6CP51160 858 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKAG1P54619 331 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX10P56693 466 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM193AP78312 1265 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SP2Q02086 613 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA1AQ53H76 456 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TREML2Q5T2D2 321 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF220Q5VTB9 566 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF12L1Q5VU92 463 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FMNL3Q8IVF7 1028 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC8Q8TAM2 541 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF384Q8TF68 577 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 OBP2AQ9NY56 170 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP19O94966 1318 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MASP2O00187 686 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLIM4O00461 696 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ONECUT2O95948 504 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRGP04196 525 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSF1RP07333 972 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 JUPP14923 745 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLRC1P26715 233 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPKBP27987 946 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEX2P28328 305 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADORA2AP29274 412 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGKEP52429 567 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNGA2Q16280 664 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MICU3Q86XE3 530 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC71Q8N4P6 559 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR56A3Q8NH54 315 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLG1Q92896 1179 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPSB4Q96A44 273 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 R3HDM4Q96D70 268 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 A1L4Q6 167 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YIZ8 118 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERBB2P04626 1255 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYF5P13349 255 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHCEP18577 417 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNA3P22001 575 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2C18P33260 490 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE1AP54750 535 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHDQ02161 417 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 NHLH1Q02575 133 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 CERCAMQ5T4B2 595 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 XAGE5Q8WWM1 108 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D5Q92609 795 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-552P-201ENST00000362869 APIPQ96GX9 242 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms