RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 HOXC6P09630 235 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF149Q8NC42 400 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 C2CD2LO14523 706 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 BBS9Q3SYG4 887 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC125Q86Z20 511 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 RFX6Q8HWS3 928 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM167AQ96KS9 214 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 BATF3Q9NR55 127 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FZD1Q9UP38 647 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ADRA1DP25100 572 aa22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 NAA25Q14CX7 972 aa22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 MIEF2Q96C03 454 aa22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 VPS11Q9H270 941 aa22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTDSS1-201ENST00000337004 T-ENOLP0DO92 83 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 CCNG1P51959 295 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 NPHS2Q9NP85 383 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 PARP14Q460N5 1801 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 ABLIM1O14639 778 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 MCF2LO15068 1137 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 B4GALT4O60513 344 aa22.5■■□□□ 1.19
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PTDSS1-201ENST00000337004 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 BANPQ8N9N5 519 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 MZB1Q8WU39 189 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 CYTH2Q99418 400 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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PTDSS1-201ENST00000337004 SIP14410 1827 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR91A4D1P6 747 aa22.5■■□□□ 1.19
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PTDSS1-201ENST00000337004 ACAP1Q15027 740 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 XYLT1Q86Y38 959 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 EMC1Q8N766 993 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 CPXM1Q96SM3 734 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 POLIQ9UNA4 740 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM63AO94886 807 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 MT-ND3P03897 115 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR78Q5VTH9 848 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTDSS1-201ENST00000337004 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.49■■□□□ 1.19
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PTDSS1-201ENST00000337004 METTL7BQ6UX53 244 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 HSPH1Q92598 858 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 RSAD1Q9HA92 442 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 DOCK1Q14185 1865 aa22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1-201ENST00000337004 PIAS1O75925 651 aa22.48■■□□□ 1.19
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