RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 PTPRJQ12913 1337 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 GDF9O60383 454 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 NOL4O94818 638 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 TNNC2P02585 160 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CASP1P29466 404 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 LHX1P48742 406 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 EHHADHQ08426 723 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 PDGFRLQ15198 375 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 GAB3Q8WWW8 586 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.6■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 UBE4BO95155 1302 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 GABRDO14764 452 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 EGFP01133 1207 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 PCSK1P29120 753 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 MTF1Q14872 753 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC142Q17RM4 750 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 DPH6Q7L8W6 267 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 WDR49Q8IV35 697 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 RDH13Q8NBN7 331 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 HPDLQ96IR7 371 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 MYRFLQ96LU7 910 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.59■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CLIC2O15247 247 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 HCRTO43612 131 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 RNF40O75150 1001 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 ADRB1P08588 477 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 AFMP43652 599 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CUL4BQ13620 913 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 PPM1JQ5JR12 505 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.58■■□□□ 1.21
SOCS1-201ENST00000332029 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 AXIN1O15169 862 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC192P0DO97 292 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 DRD1P21728 446 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 GJA4P35212 333 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 GALK1P51570 392 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CYP2J2P51589 502 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CPA6Q8N4T0 437 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 TTC16Q8NEE8 873 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 EXOC4Q96A65 974 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 LOXL4Q96JB6 756 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 FNBP1Q96RU3 617 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ECT2Q9H8V3 914 aa22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CKMP06732 381 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 USP17L7P0C7H9 530 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 TNNI1P19237 187 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CYP24A1Q07973 514 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 USP4Q13107 963 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF77Q15935 545 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO43Q4G163 708 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 KBTBD6Q86V97 674 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SLC22A12Q96S37 553 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ACACBO00763 2458 aa22.56■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 EPN2O95208 641 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 RAP1GAPP47736 663 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 IFNAR2P48551 515 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 PSMD6Q15008 389 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC6Q16204 474 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 FAM171BQ6P995 826 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms