RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318121.7

CLSPN-202, Transcript of claspin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSPN, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPN-202ENST00000318121 LTBP2Q14767 1821 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ALPK3Q96L96 1907 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PRRG1O14668 218 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CA3P07451 260 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ABCB4P21439 1286 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 KLRC2P26717 231 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RABGGTBP53611 331 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ERVK-21P61565 698 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 NOMO3P69849 1222 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CENPCQ03188 943 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ORC1Q13415 861 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 FAM171BQ6P995 826 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 UBA3Q8TBC4 463 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 B4GALT3O60512 393 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 LCA5LO95447 670 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 DNAJB2P25686 324 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 GALCP54803 685 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ODF2Q5BJF6 829 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RTL10Q7L3V2 364 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ITIH5Q86UX2 942 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 POF1BQ8WVV4 589 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RFFLQ8WZ73 363 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 TFAP2BQ92481 460 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 DESI2Q9BSY9 194 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ISCUQ9H1K1 167 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PARVAQ9NVD7 372 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 COMMD8Q9NX08 183 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 MYO1FO00160 1098 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 C1RP00736 705 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CCDC130P13994 396 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CHRNB2P17787 502 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 BDNFP23560 247 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CETN2P41208 172 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 EPHB3P54753 998 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RAB33AQ14088 237 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PTPN14Q15678 1187 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 TMEM139Q8IV31 216 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 C12orf29Q8N999 325 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 TIFAQ96CG3 184 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PCED1BQ96HM7 432 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 TCF25Q9BQ70 676 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 HCSTQ9UBK5 93 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 GLUD1P00367 558 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PDCLQ13371 301 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 RTP2Q5QGT7 225 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 FUKQ8N0W3 1084 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 GCNAQ96QF7 691 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSPN-202ENST00000318121 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms