RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 FUOMA2VDF0 154 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 CFAP69A5D8W1 941 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 CDH16O75309 829 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 BAG2O95816 211 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 H2AFZP0C0S5 128 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 VGLL4Q14135 290 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 TGFBIQ15582 683 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 MYLK3Q32MK0 819 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 H2AFVQ71UI9 128 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 TTC1Q99614 292 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 GAS7O60861 476 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC6O75061 913 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 SFT2D3Q587I9 215 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 TPH2Q8IWU9 490 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 FAM161BQ96MY7 647 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 TSG101Q99816 390 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 PTPRAP18433 802 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 DOCK1Q14185 1865 aa22.91■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 CIB2O75838 187 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 TTC4O95801 387 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 MMEL1Q495T6 779 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 AAGABQ6PD74 315 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 STARD8Q92502 1023 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 HGH1Q9BTY7 390 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 SPAG7O75391 227 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 CYP2C9P11712 490 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 HOXD13P35453 343 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 CETN2P41208 172 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 BIRC8Q96P09 236 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 BTBD9Q96Q07 612 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 GANQ9H2C0 597 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 AAASQ9NRG9 546 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 GINM1Q9NU53 330 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 AK5Q9Y6K8 562 aa22.9■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 USP1O94782 785 aa22.89■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 DLG1Q12959 904 aa22.89■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.89■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.89■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.89■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.89■■□□□ 1.26
PITX1-201ENST00000265340 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 BCAP31P51572 246 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 ALLCQ8N6M5 410 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 PRELID2Q8N945 189 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 PHF12Q96QT6 1004 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 PANX3Q96QZ0 392 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 CYTH2Q99418 400 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 DKK3Q9UBP4 350 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.89■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 SFI1A8K8P3 1242 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 RASA4BC9J798 803 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 RASA4O43374 803 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 CTNNA2P26232 953 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 BACE1P56817 501 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.88■■□□□ 1.25
PITX1-201ENST00000265340 ZNF280DQ6N043 979 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms