RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 NAA35Q5VZE5 725 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PMF1Q6P1K2 205 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 FAM171BQ6P995 826 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 FAM35AQ86V20 835 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CLEC4CQ8WTT0 213 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TNIP3Q96KP6 325 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.51□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 AP1G2O75843 785 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 GABBR2O75899 941 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 RFX1P22670 979 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 GRIK1P39086 918 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PGFP49763 221 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TRIM14Q14142 442 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 UNC93AQ86WB7 457 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 VN1R2Q8NFZ6 395 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SMOQ99835 787 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 DEF6Q9H4E7 631 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.5□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ABL1P00519 1130 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 RB1P06400 928 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ATF6P18850 670 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ABCB4P21439 1286 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ZNF461Q8TAF7 563 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CPXM1Q96SM3 734 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PRRG1O14668 218 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CLCN4P51793 760 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 USP46P62068 366 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 GPR17Q13304 367 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TCEAL5Q5H9L2 206 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 MYLIPQ8WY64 445 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 AGPAT1Q99943 283 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SYT11Q9BT88 431 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 MIS12Q9H081 205 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 IMPACTQ9P2X3 320 aa11.49□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 GRAP2O75791 330 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SERPING1P05155 500 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PAEPP09466 180 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 VDRP11473 427 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 LCP1P13796 627 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ATF2P15336 505 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 FERP16591 822 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 GPD2P43304 727 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 KIF11P52732 1056 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CCZ1BP86790 482 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CDR2Q01850 454 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TAF5Q15542 800 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CLUL1Q15846 466 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 MEA1Q16626 185 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PIGZQ86VD9 579 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CCDC42Q96M95 316 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TLE6Q9H808 572 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PTPRDP23468 1912 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 E5RJQ4 531 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 H7C4K7 107 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 FSCN2O14926 492 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 AKR1B10O60218 316 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 DEFB123Q8N688 67 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 LZTS1Q9Y250 596 aa11.48□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.47□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 OR6C75A6NL08 312 aa11.47□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CCL16O15467 120 aa11.47□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TTPA-201ENST00000260116 ABLIM3O94929 683 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms