RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SH3GL1Q99961 368 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 E7ENQ6 273 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GRIK1P39086 918 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SAAL1Q96ER3 474 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C8orf4Q9NR00 106 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MGEA5O60502 916 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 STX5Q13190 355 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZNF235Q14590 738 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NXNQ6DKJ4 435 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ATG4CQ96DT6 458 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PGM2Q96G03 612 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 IL25Q9H293 177 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ABCA3Q99758 1704 aa6.6□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ACSL3O95573 720 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CRTAMO95727 393 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AP1B1Q10567 949 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 XRCC4Q13426 336 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CFAP99D6REC4 459 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PPP3CCP48454 512 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MTMR8Q96EF0 704 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ABL1P00519 1130 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ARFIP2P53365 341 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PTP4A2Q12974 167 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AADATQ8N5Z0 425 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MS4A14Q96JA4 679 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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SETX-201ENST00000224140 JAMLQ86YT9 394 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 LRRC43Q8N309 656 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MREGQ8N565 214 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FAM86B1E9PN63 330 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SLC7A5Q01650 507 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PEX6Q13608 980 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HIC1Q14526 733 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 INSCQ1MX18 579 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 USP49Q70CQ1 688 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 STRADAQ7RTN6 431 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 Q9Y3F1 56 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MEIS2O14770 477 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.59□□□□□ -1.35
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SETX-201ENST00000224140 OPTNQ96CV9 577 aa6.59□□□□□ -1.35
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SETX-201ENST00000224140 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MPOP05164 745 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NPY2RP49146 381 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ST8SIA6P61647 398 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GRIN1Q05586 938 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CDO1Q16878 200 aa6.59□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZNF394Q53GI3 561 aa6.59□□□□□ -1.35
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