RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174939.1

Snord55-201, mousemouse

BASIC

Gene Snord55, Length 79 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup5P11591 180 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Stat4P42228 749 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 NsfP46460 744 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gad1P48318 593 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Polr2fP61219 127 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Phactr1Q2M3X8 580 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ap5z1Q3U829 807 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ttc9Q3V038 219 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Traf3Q60803 567 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Znf512Q69Z99 562 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cep70Q6IQY5 616 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 PdgfrlQ6PE55 375 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Asic3Q6X1Y6 530 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Bank1Q80VH0 783 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Wdtc1Q80ZK9 677 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Psmd5Q8BJY1 504 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Slc9a4Q8BUE1 797 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gpc5Q8CAL5 572 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Q8CD60 292 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fbxl13Q8CDU4 790 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Defb36Q8K3U4 67 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 BbxQ8VBW5 907 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam114a2Q8VE88 497 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ier5lQ99J55 406 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rpa3Q9CQ71 121 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ergic2Q9CR89 377 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rgs19Q9CX84 216 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Klhl40Q9D783 621 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam217aQ9D9W6 419 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Uchl3Q9JKB1 230 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Trim44Q9QXA7 346 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Nme7Q9QXL8 395 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa11.66□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Tp53bp1P70399 1969 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lrrc63A6H694 637 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rabgap1lA6H6A9 815 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 TpteG5E8H5 664 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Scgb2b19J3QM75 112 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 KlO35082 1014 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gucy1b3O54865 620 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Acot1O55137 419 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ca3P16015 260 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gsdmc4Q3TR54 480 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Erich4Q3UNU4 136 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sema5aQ62217 1077 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gstt1Q64471 240 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Anp32cQ64G17 123 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ttyh3Q6P5F7 524 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cpa4Q6P8K8 420 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Paqr9Q6TCG2 375 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Kcnf1Q7TSH7 493 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 WhrnQ80VW5 918 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Neto2Q8BNJ6 525 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam43aQ8BUP8 424 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Arhgef33Q8BW86 850 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 SgczQ8BX51 311 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gsdmc3Q8CB12 480 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Myt1Q8CFC2 1127 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Trim61Q8JZK6 461 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Igsf8Q8R366 611 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Q922M7 232 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Npffr2Q924H0 417 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Pard3bQ9CSB4 1203 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Q9D454 513 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Trpv2Q9WTR1 756 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa11.65□□□□□ -0.54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Arhgef10Q8C033 1345 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam81bA0A140LI28 432 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup10A2BIN1 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup14A2CEK7 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup19A9C497 187 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup15A9R9W0 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup17B5X0G2 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup8E9PVW0 235 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup7E9QA79 235 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cldn5O54942 218 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup6P02762 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup1P11588 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mup2P11589 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Flt3lgP49772 232 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 AdprhP54923 362 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ano9P86044 747 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam171bQ14CH0 825 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ccdc61Q3UJV1 511 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 LpoQ5SW46 710 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 CttnQ60598 546 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Bag1Q60739 355 aa11.64□□□□□ -0.55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sh3gl1Q62419 368 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.7 ms