RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nek8Q91ZR4 698 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mageb3Q9D2H4 330 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rsph3bQ9DA80 389 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmod2Q9JKK7 351 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb1Q9WV74 336 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc10a3P21129 473 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map4k1P70218 827 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mical2Q8BML1 960 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pak4Q8BTW9 593 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmd6Q99JI4 389 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gdap2Q9DBL2 498 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20721E9Q2U8 318 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp94E9Q6Y4 486 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3424L7N298 263 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8246M0QWX9 263 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsd17b2P51658 381 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf507Q6ZPY5 941 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Impg2Q80XH2 1243 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SncaipQ99ME3 962 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt8Q9CR24 210 aa16.77■□□□□ 0.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pds5aQ6A026 1332 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm28043E0CXC2 719 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clca3bE9PUL3 1044 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rasgrf2P70392 1189 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf220Q6PDX6 566 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp454Q80Y34 536 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8CIL4 281 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pacsin3Q99JB8 424 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hars2Q99KK9 505 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Capn7Q9R1S8 813 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arih1Q9Z1K5 555 aa16.77■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4931406B18RikA2RSL7 367 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5689F6Y2A6 97 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SfnO70456 248 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdlim7Q3TJD7 457 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map3k9Q3U1V8 1077 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmed1Q3V009 227 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4952Q5FW57 296 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pik3r5Q5SW28 871 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt1a1Q63886 535 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp6nlQ80XC3 819 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nipa1Q8BHK1 323 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hdac7Q8C2B3 938 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rtp1Q8C8C1 263 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kdm4bQ91VY5 1086 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Setd3Q91WC0 594 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tceal1Q921P9 165 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 StambpQ9CQ26 424 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Castor1Q9CWQ8 331 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Jph2Q9ET78 696 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B4galt5Q9JMK0 388 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcb5B5X0E4 1255 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfrsf18O35714 228 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rtn2O70622 471 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpysl3Q62188 570 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ripor1Q68FE6 1223 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cypt2Q6P924 180 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr670Q7TRP3 312 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf579Q80VM4 562 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnksr2Q80YA9 1032 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf112Q96DY5 654 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cox16Q9CR63 106 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp5hQ9DCX2 161 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Skint3A7TZF0 458 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lipo3Q3UT41 399 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oog3Q3UWY1 500 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrif1Q8CDD9 755 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Otud7aQ8R554 926 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ophn1Q99J31 802 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rilpl2Q99LE1 197 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9CPS8 106 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt20Q9D312 431 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc97Q9DBT3 340 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmg1Q9JK23 289 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccr10Q9JL21 362 aa16.76■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam107aQ78TU8 144 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RimklbQ80WS1 387 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep57Q8CEE0 500 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pofut2Q8VHI3 429 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btaf1E9QAE3 1848 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oog1E9Q5G7 496 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elk3P41971 409 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf112Q0VAW7 879 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem63bQ3TWI9 832 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccser1Q8C0C4 895 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms