RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IhhP97812 411 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SlmapQ3URD3 845 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Runx3Q64131 409 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atg9bQ6EBV9 922 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1415Q7TQS4 311 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AgmoQ8BS35 447 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankk1Q8BZ25 745 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc35f5Q8R314 524 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1416Q8VGU4 312 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc39a5Q9D856 535 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cbx6Q9DBY5 414 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adamts5Q9R001 930 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grin2dQ03391 1323 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ntsr2P70310 416 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gsdmc4Q3TR54 480 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk40Q7TNL3 435 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim65Q8BFW4 522 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gsdmc3Q8CB12 480 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nme7Q9QXL8 395 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf103Q9R1W3 683 aa24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pgrmc1O55022 195 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stat4P42228 749 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep95Q8BVV7 827 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CtbsQ8R242 366 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AagabQ8R2R3 316 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q91Z58 1206 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smtnl1Q99LM3 459 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankrd1Q9CR42 319 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gfra4Q9JJT2 260 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpv2Q9WTR1 756 aa24.07■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm9992B2RWK3 458 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cldn5O54942 218 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pla2g4bP0C871 782 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mup5P11591 180 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcpt2P15119 244 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtmaP26350 111 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcm4P49717 862 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tyro3P55144 880 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina5P70458 405 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Perm1Q149B8 807 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrch2Q3UMG5 773 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pik3r5Q5SW28 871 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cldn11Q60771 207 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Unc93aQ710D3 458 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RragaQ80X95 313 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ace2Q8R0I0 805 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zdhhc7Q91WU6 308 aa24.06■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gprin2D3Z1D7 455 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Speer4f2E9Q366 295 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kifc3O35231 824 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpinc1P32261 465 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc11a2P49282 568 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp46P62069 366 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vamp7P70280 220 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cntn3Q07409 1028 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc20a2Q80UP8 656 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slitrk1Q810C1 696 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q8CC96 669 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nle1Q8VEJ4 485 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gemin2Q9CQQ4 269 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mdm1Q9D067 708 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ndst4Q9EQW8 872 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PolhQ9JJN0 694 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Iigp1Q9QZ85 413 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf25Q9QZR0 456 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gadd45gQ9Z111 159 aa24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm10720D3Z1I5 223 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmp15O54732 657 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DxoO70348 397 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pik3caP42337 1068 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam171bQ14CH0 825 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q3TQQ9 903 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ift88Q61371 824 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scube3Q66PY1 993 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxw21Q8BI38 468 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc17Q8CE13 565 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zmiz2Q8CIE2 920 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atat1Q8K341 421 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Marc1Q9CW42 340 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa24.04■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Unc80Q8BLN6 3261 aa24.03■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3415J3QMS8 315 aa24.03■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cldn2O88552 230 aa24.03■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr3P35413 330 aa24.03■■□□□ 1.44
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hspa4lP48722 838 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19 ms