RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	TEM1	P38987	245 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YMR141C	P40211	102 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	HST4	P53688	370 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YNR064C	P53750	290 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	ATP19	P81451	68 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	MRX11	Q03079	207 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	GIM5	Q04493	163 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	IRC25	Q07951	179 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	NAT5	Q08689	176 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	FYV7	Q12247	151 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	ZRT1	P32804	376 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	RPA43	P46669	326 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SUR7	P54003	302 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	CSI2	Q08054	341 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	CSM4	Q08955	156 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	MRS1	P07266	363 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YPS1	P32329	569 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	TIR2	P33890	251 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	PAU16	P35994	123 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	GLE2	P40066	365 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SAE3	P89114	91 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SDH7	Q04401	133 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	HTB2	P02294	131 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	ATP5	P09457	212 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YKL102C	P34249	101 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	RRT1	P38192	103 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	GPI18	P38211	433 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YFR045W	P43617	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YIP1	P53039	248 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	DAD4	P69851	72 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	MSC3	Q05812	728 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	GLC8	P41818	229 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	IMP2	P46972	177 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	BRP1	P53194	125 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YDL157C	Q12082	118 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	COX2	P00410	251 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	STF1	P01098	86 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	NCA3	P46955	337 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YGL118C	P53132	145 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	YGR017W	P53210	297 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	TIM18	Q08749	192 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	DAD1	Q12248	94 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TRS33	YOR115C	SEC11	P15367	167 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YCR041W	P37265	110 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	HAC1	P41546	238 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	SBH2	P52871	88 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YGL230C	P53074	147 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	DPP1	Q05521	289 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	BPH1	P25356	2167 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	CYC3	P06182	269 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	CPT1	P17898	393 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	PET8	P38921	284 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	PAU7	P39545	55 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YER188W	P40103	239 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YIL012W	P40551	113 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YIR020C	P40575	100 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YPI1	P43587	155 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YGR025W	P53216	100 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	GTO3	Q04806	366 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	CNL1	Q06333	122 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YPL162C	Q12042	273 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	MEC1	P38111	2368 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	PHO85	P17157	305 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	UTR5	P32630	166 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	TOA2	P32774	122 aa		3.81	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms