RNA–Protein interactions for RNA: YHR052W

CIC1, Transcript of Essential protein that interacts with proteasome components, yeast

Gene CIC1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIC1	YHR052W	COX5B	P00425	151 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	COX8	P04039	78 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	SEC59	P20048	519 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	FYV5	P25585	152 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YCR050C	P25630	102 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	SNF11	P38956	169 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YAL064W	P39711	94 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	VMA21	P41806	77 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	CAT8	P39113	1433 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	HSL1	P34244	1518 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	TSC11	P40061	1430 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	PDR11	P40550	1411 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	TRM732	Q03496	1420 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	VAR1	P02381	398 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YCR099C	P25657	155 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	SRB6	P32570	121 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YKL044W	P36092	106 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	SRL3	P36167	246 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	QCR10	P37299	77 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YHL042W	P38729	150 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	PAM16	P42949	149 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	SOM1	Q05676	74 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	HPA2	Q06592	156 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	DAD1	Q12248	94 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	COA6	Q3E846	104 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	MSB2	P32334	1306 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	FUN14	P18411	198 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YEL067C	P39978	195 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	GPI11	Q06636	219 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	SWC7	Q06707	132 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	FYV12	Q08559	129 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YOR385W	Q08909	290 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	REV3	P14284	1504 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	BUD4	P47136	1447 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YCR101C	P25607	182 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YBR090C	P38253	122 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YBR242W	P38331	238 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YEL014C	P39999	101 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	GAT4	P40569	121 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	GTT1	P40582	234 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	VAM10	Q08474	114 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	GTT2	Q12390	233 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	OCA6	Q12454	224 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
CIC1	YHR052W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	MRPL15	P36523	253 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
CIC1	YHR052W	TRS20	P38334	175 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	IPT1	P38954	527 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	DCV1	P43595	202 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YGR164W	P53291	111 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	NHP10	Q03435	203 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	IRC21	Q04772	201 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	ELP6	Q04868	273 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	FIT2	Q08906	153 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	KRE5	P22023	1365 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	HAP2	P06774	265 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	PFY1	P07274	126 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YEA6	P39953	335 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YFL051C	P43552	160 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	HUR1	P45820	110 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	AIM18	P38884	321 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YER187W	P40102	141 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	YFL065C	P43539	102 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	SNN1	P48232	102 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	BRP1	P53194	125 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CIC1	YHR052W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27

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