RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeastyeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL3YBL037W RRT7Q07829 113 aa0.68□□□□□ -2.3
APL3YBL037W ATG41Q12048 136 aa0.68□□□□□ -2.3
APL3YBL037W ADK1P07170 222 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W PET54P10834 293 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W PRE1P22141 198 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data0.67□□□□□ -2.3not detected
APL3YBL037W YEL073CP39974 107 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YJR015WP47090 510 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W GEP7P53171 287 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W DML1Q03652 475 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W RPB7P34087 171 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W CWC27Q02770 301 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W FIT2Q08906 153 aa0.67□□□□□ -2.3
APL3YBL037W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W CSH1P38287 376 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W FLX1P40464 311 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W CIN5P40917 295 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W NSE4P43124 402 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W LSM1P47017 172 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W MOG1P47123 218 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W SOL1P50278 321 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W THG1P53215 237 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YNR064CP53750 290 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YPR202WQ08993 238 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W MYO1P08964 1928 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W PHO85P17157 305 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W SLM6P38343 150 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W HPA3P39979 161 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YGR269WP40326 108 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W CCC1P47818 322 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W HHO1P53551 258 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W RIM9Q04734 239 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W RNH202Q05635 350 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W UPS1Q05776 175 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W COA3Q3E7B2 85 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YBL010CP32788 280 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W YHP1Q04116 353 aa0.66□□□□□ -2.3
APL3YBL037W SPS2P08459 502 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W MAK31P23059 88 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W AHT1P29589 182 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W UPS2P35200 230 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W CCS1P40202 249 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W PAC10P48363 199 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W UBC7Q02159 165 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W ATG10Q07879 167 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W STT4P37297 1900 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W MOT1P32333 1867 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W CPR5P35176 225 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YEL067CP39978 195 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W ORM1P53224 222 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YDR366CP87287 132 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YDR278CQ05612 105 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W VAM10Q08474 114 aa0.65□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YHL042WP38729 150 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W GPI2P46961 280 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W SPG1P50088 95 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YMR007WQ03675 126 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W KEI1Q06346 221 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YOR381W-AQ3E804 55 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W SUI1P32911 108 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W ECM31P38122 312 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W GIM4P40005 111 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W FIP1P45976 327 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YKL068W-AQ3E826 78 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YLR422WQ06409 1932 aa0.64□□□□□ -2.31
APL3YBL037W PHO13P19881 312 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YCL042WP25572 119 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W SRP21P32342 167 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W HSP10P38910 106 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YER181CP40097 107 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W FMN1Q03778 218 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W PST2Q12335 198 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W OCA6Q12454 224 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W FMP27Q06179 2628 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W AQY2P0CD90 149 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W RPC19P28000 142 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W PDX3P38075 228 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YPT31P38555 223 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W SWM2P40342 146 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W APS3P47064 194 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W RBL2P48606 106 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W ATP14Q12349 124 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W HYP2P23301 157 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W POP7P38291 140 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YGL204CP53089 101 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YGR039WP53225 103 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W YGR164WP53291 111 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W RCF2P53721 224 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W TVP18Q04767 167 aa0.63□□□□□ -2.31
APL3YBL037W ELP6Q04868 273 aa0.63□□□□□ -2.31
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