RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ACBD6Q9BR61 282 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 IL23AQ9NPF7 189 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 PARVAQ9NVD7 372 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 HCSTQ9UBK5 93 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC23Q9UJX2 597 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-215ENST00000628018 SAR1BQ9Y6B6 198 aa26.33■■□□□ 1.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC3O43617 180 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 NCK2O43639 380 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 AMHP03971 560 aa26.32■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 PCSK1P29120 753 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ADORA2BP29275 332 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC11A1P49279 550 aa26.32■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TJP2Q9UDY2 1190 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM28Q9UKQ2 775 aa26.32■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TADA2AO75478 443 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 BAIAP3O94812 1187 aa26.31■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 BCAT1P54687 386 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR5P61964 334 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE4CQ08493 712 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC142Q17RM4 750 aa26.31■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 OVOS1Q6IE37 1185 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 FUKQ8N0W3 1084 aa26.31■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 STK32AQ8WU08 396 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH5Q9NX47 278 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.31■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 GALTP07902 379 aa26.3■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa26.3■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 PEX26Q7Z412 305 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 XYLT1Q86Y38 959 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 BTBD6Q96KE9 485 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ANAPC7Q9UJX3 599 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG6Q9Y672 507 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MYBPHLA2RUH7 354 aa26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 PLCB3Q01970 1234 aa26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 MESDQ14696 234 aa26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 SYNCQ9H7C4 482 aa26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 AMFRQ9UKV5 643 aa26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 HYOU1Q9Y4L1 999 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SYN3O14994 580 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP16Q9BY84 665 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM7Q9C029 511 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MIS12Q9H081 205 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CWH43Q9H720 699 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ST7Q9NRC1 585 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OAZ2O95190 189 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TCP1P17987 556 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL34P49207 117 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TAP1Q03518 808 aa26.28■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM110Q86TL2 294 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10T2Q8NGX3 314 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MCRS1Q96EZ8 462 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 PCED1BQ96HM7 432 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 HES6Q96HZ4 224 aa26.28■■□□□ 1.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 PKMYT1Q99640 499 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM191CA6NGB0 347 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 E5RJQ4 531 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO1FO00160 1098 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN5O00501 218 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SRGAP2O75044 1071 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 GJB6O95452 261 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-215ENST00000628018 BCAR1P56945 870 aa26.27■■□□□ 1.8
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