RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 CYLDQ9NQC7 956 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 H0YIN7 160 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 FBP2O00757 339 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEB2O15479 319 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ADCY6O43306 1168 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINB7O75635 380 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 BGNP21810 368 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 RELAQ04206 551 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 DMPKQ09013 629 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 PDK1Q15118 436 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 EPHA7Q15375 998 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 CYTH1Q15438 398 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 SMUG1Q53HV7 270 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 SFR1Q86XK3 245 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ACER1Q8TDN7 264 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 AKT1S1Q96B36 256 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 CEP63Q96MT8 703 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 CENPOQ9BU64 300 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM17Q9Y577 477 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf42Q9H799 3197 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GUL6 1792 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 MED24O75448 989 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM49P0CI25 452 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM49CP0CI26 452 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 BCRP11274 1271 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 MUTP22033 750 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEA4P43358 317 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 RHBDL3P58872 404 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 PSMC6P62333 389 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF543Q08ER8 600 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ARSHQ5FYA8 562 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 SNF8Q96H20 258 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 NENFQ9UMX5 172 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 DNM3Q9UQ16 869 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-211ENST00000618610 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EDIL3O43854 480 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 IVDP26440 423 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CIITAP33076 1130 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RCVRNP35243 200 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 NPEPPSP55786 919 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CDK16Q00536 496 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 C2CD6Q53TS8 623 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK13Q9HB14 408 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB5O15062 677 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RSPH10BP0C881 870 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ETS1P14921 441 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SOX5P35711 763 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ACTR3P61158 418 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TMC7Q7Z402 723 aa8.58□□□□□ -1.04
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