RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 NOL4O94818 638 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 RETP07949 1114 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SDHBP21912 280 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CNR2P34972 360 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 MON1AQ86VX9 555 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 HPS3Q969F9 1004 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SOBPA7XYQ1 873 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 GABRDO14764 452 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPATA18Q8TC71 538 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 INTS13Q9NVM9 706 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTPRDP23468 1912 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 STX6O43752 255 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARSAP15289 507 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 LHX1P48742 406 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 STK38Q15208 465 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYRFLQ96LU7 910 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TNMDQ9H2S6 317 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRP3O75074 770 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCSK1P29120 753 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOXA6P31267 233 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOXD13P35453 343 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYO1EQ12965 1108 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 E2F4Q16254 413 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 HPDLQ96IR7 371 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC22A12Q96S37 553 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF233A6NK53 670 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP2C2O75185 946 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTF1Q14872 753 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM171BQ6P995 826 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYT15Q9BQS2 421 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 RTKNQ9BST9 563 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIM9Q9C026 710 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 EML5Q05BV3 1969 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPTBN2O15020 2390 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPTLC2O15270 562 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 EGFP01133 1207 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 TNNC2P02585 160 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 LMO2P25791 158 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDGFRLQ15198 375 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SURF1Q15526 300 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF77Q15935 545 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP68Q76N32 757 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 DPH6Q7L8W6 267 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYLPFQ96A32 169 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF40O75150 1001 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CKMP06732 381 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAGEA11P43364 429 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 ASIC1P78348 528 aa22.24■■□□□ 1.15
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