RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 TUFMP49411 452 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 NDST1P52848 882 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 INCA1Q0VD86 236 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CFAP221Q4G0U5 840 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 WDR44Q5JSH3 913 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 GJD3Q8N144 294 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MYLPFQ96A32 169 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP3A43Q9HB55 503 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ABCB6Q9NP58 842 aa12.08□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 RHOP08100 348 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPN2P17706 415 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP2F1P24903 491 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ALDH1A3P47895 512 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 PLD1Q13393 1074 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ORC1Q13415 861 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 NFKBIBQ15653 356 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 UNC93AQ86WB7 457 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM114A1Q8IWE2 563 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 WHAMMQ8TF30 809 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 TWNKQ96RR1 684 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CORO1BQ9BR76 489 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 FUCA2Q9BTY2 467 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 USTQ9Y2C2 406 aa12.07□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 GREB1Q4ZG55 1949 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 SYCE3A1L190 88 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNJ18B7U540 433 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 C2CD4DB7Z1M9 353 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CILPO75339 1184 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CD58P19256 250 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR15P49685 360 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 EPHB3P54753 998 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP27A1Q02318 531 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CETN1Q12798 172 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 LRMPQ12912 555 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNJ12Q14500 433 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MAN2A1Q16706 1144 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ANO6Q4KMQ2 910 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MIIPQ5JXC2 388 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CDKAL1Q5VV42 579 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 IQCEQ6IPM2 695 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ACOT1Q86TX2 421 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CRYBG2Q8N1P7 616 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ELMOD1Q8N336 334 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 PSMG2Q969U7 264 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 TNIP3Q96KP6 325 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC3Q9BY71 257 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 B3GNT5Q9BYG0 378 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CISHQ9NSE2 258 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 FANCLQ9NW38 375 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 NR2E1Q9Y466 385 aa12.06□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CLDN5O00501 218 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 BDNFP23560 247 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 FSHRP23945 695 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CCR2P41597 374 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MAGEA11P43364 429 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 EPHA5P54756 1037 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MYL5Q02045 173 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 CUL2Q13617 745 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 NCAPHQ15003 741 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 DDR2Q16832 855 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 TCP11X2Q5H9J9 407 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 SDHAF4Q5VUM1 108 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 PAQR9Q6ZVX9 377 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 OTOP3Q7RTS5 596 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 TMC8Q8IU68 726 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 C12orf29Q8N999 325 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 STKLD1Q8NE28 680 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ITFG1Q8TB96 612 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR152Q8TDT2 470 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 GIPC2Q8TF65 315 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 NT5C1BQ96P26 610 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 MYADMQ96S97 322 aa12.05□□□□□ -0.48
CCL3L3-201ENST00000612839 ELOVL4Q9GZR5 314 aa12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms