RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 TEX33O43247 280 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 ATP2C2O75185 946 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 CLSTN1O94985 981 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 SEC24AO95486 1093 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 SERPINC1P01008 464 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 PDGFRBP09619 1106 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 ATF6P18850 670 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 CD58P19256 250 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 EPHA5P54756 1037 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 MFAP3P55082 362 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 ITIH3Q06033 890 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 PLD1Q13393 1074 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 STILQ15468 1287 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 GJB7Q6PEY0 223 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 RRAGAQ7L523 313 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 ACOT1Q86TX2 421 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 PALB2Q86YC2 1186 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 HLA-CQ95604 372 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 SPATA17Q96L03 361 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 C8orf48Q96LL4 319 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 S1PR5Q9H228 398 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 CLDND1Q9NY35 253 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 ASB3Q9Y575 518 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-221ENST00000591856 COL6A3P12111 3177 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 PRRG1O14668 218 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 TRIM66O15016 1216 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 CBFA2T2O43439 604 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 XYLBO75191 536 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 RFPL2O75678 378 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 TPM3P06753 285 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 VDRP11473 427 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 KLK7P49862 253 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 UBASH3AP57075 661 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 PKDCCQ504Y2 493 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM270Q6UE05 265 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 GPR149Q86SP6 731 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 LEMD2Q8NC56 503 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 RNF214Q8ND24 703 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 PSMG2Q969U7 264 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 STK33Q9BYT3 514 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 RBSNQ9H1K0 784 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 IGFLR1Q9H665 355 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 KRT82Q9NSB4 513 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 IFNKQ9P0W0 207 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 CD207Q9UJ71 328 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 EYSQ5T1H1 3165 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 NCANO14594 1321 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PQJ5 194 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM92AA1XBS5 289 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 SPATA31D3P0C874 917 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM200BP0CF97 657 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 SETSIPP0DME0 302 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC130P13994 396 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 NPR3P17342 541 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNA5P22460 613 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 CYP2F1P24903 491 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 ELF1P32519 619 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 ARPP19P56211 112 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-221ENST00000591856 DUSP4Q13115 394 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms