RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 NOL4O94818 638 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 KRT19P08727 400 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 PDCP20941 246 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 HOXA6P31267 233 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 RUNX3Q13761 415 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 MON1AQ86VX9 555 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ADGRF2Q8IZF7 708 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SYCP3Q8IZU3 236 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 PDILTQ8N807 584 aa13□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ACBD6Q9BR61 282 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ABCB6Q9NP58 842 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SEMA4GQ9NTN9 838 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 PANK4Q9NVE7 773 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 GDAP2Q9NXN4 497 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 MTMR6Q9Y217 621 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SNX9Q9Y5X1 595 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 GABRDO14764 452 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 LRP3O75074 770 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ATP2C2O75185 946 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 EGFP01133 1207 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CSH1P0DML2 217 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CSH2P0DML3 217 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 HOXD13P35453 343 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 USP4Q13107 963 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SLC39A14Q15043 492 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 WDR5BQ86VZ2 330 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CBWD2Q8IUF1 395 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 TMEM86AQ8N2M4 240 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SYNPOQ8N3V7 929 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CYP2S1Q96SQ9 504 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 RTKNQ9BST9 563 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 KIF9Q9HAQ2 790 aa12.99□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 C2orf78A6NCI8 922 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 RNF40O75150 1001 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 LDHAP00338 332 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 TMEM191BP0C7N4 346 aa12.98□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 LMO2P25791 158 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CNR2P34972 360 aa12.98□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 MTF1Q14872 753 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ZNF77Q15935 545 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CCDC6Q16204 474 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CSRP2Q16527 193 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CFAP221Q4G0U5 840 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CEP68Q76N32 757 aa12.98□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 GPD1LQ8N335 351 aa12.98□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 NETO1Q8TDF5 533 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 MYRFLQ96LU7 910 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 TRPC7Q9HCX4 862 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 INTS13Q9NVM9 706 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ZMYM5Q9UJ78 669 aa12.98□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 NME7Q9Y5B8 376 aa12.98□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.97□□□□□ -0.33
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CTIF-208ENST00000590422 GJA4P35212 333 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 NASPP49321 788 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 FAM160A1Q05DH4 1040 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 E2F4Q16254 413 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 FAM171BQ6P995 826 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 KBTBD6Q86V97 674 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 HSCBQ8IWL3 235 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SCN4BQ8IWT1 228 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CTIF-208ENST00000590422 SPATA18Q8TC71 538 aa12.97□□□□□ -0.33
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