RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MON1AQ86VX9 555 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GPD1LQ8N335 351 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPATA18Q8TC71 538 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HPS3Q969F9 1004 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYRFLQ96LU7 910 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EBF3Q9H4W6 596 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM206Q9H813 350 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 INTS13Q9NVM9 706 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EML5Q05BV3 1969 aa11.9□□□□□ -0.5
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.9□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PTPRDP23468 1912 aa11.9□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 STX6O43752 255 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ATP2C2O75185 946 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ARSAP15289 507 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SDHBP21912 280 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CNR2P34972 360 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LHX1P48742 406 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 E2F4Q16254 413 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM171BQ6P995 826 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC22A12Q96S37 553 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TNMDQ9H2S6 317 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LRP3O75074 770 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LMO2P25791 158 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PCSK1P29120 753 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DPH6Q7L8W6 267 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HPDLQ96IR7 371 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRIM9Q9C026 710 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GCNT4Q9P109 453 aa11.88□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF233A6NK53 670 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPTLC2O15270 562 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TGFB1I1O43294 461 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EGFP01133 1207 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MAGEA11P43364 429 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYO1EQ12965 1108 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 USP4Q13107 963 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MTF1Q14872 753 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PDGFRLQ15198 375 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 STK38Q15208 465 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF77Q15935 545 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CSRP2Q16527 193 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SYT15Q9BQS2 421 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RTKNQ9BST9 563 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.86□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.86□□□□□ -0.51
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C2orf78A6NCI8 922 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms