RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC11A1P49279 550 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 GSCP56915 257 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP4A22Q5TCH4 519 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 METTL23Q86XA0 190 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 FUKQ8N0W3 1084 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM175Q9BSA9 504 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM7Q9C029 511 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 PARVAQ9NVD7 372 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 MARCH5Q9NX47 278 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 STRIP2Q9ULQ0 834 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 SAR1BQ9Y6B6 198 aa27.53■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 TULP2O00295 520 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 ERBB2P04626 1255 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 ACRP10323 421 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 PCSK1P29120 753 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 ADORA2BP29275 332 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR5P61964 334 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 PAQR9Q6ZVX9 377 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 BTBD6Q96KE9 485 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 ACBD6Q9BR61 282 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAM28Q9UKQ2 775 aa27.52■■■□□ 2
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCAB14O75071 495 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 PRLRP16471 622 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 BCAT1P54687 386 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 DEFB103AP81534 67 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 PDE4CQ08493 712 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 TUBB2AQ13885 445 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 MDH1BQ5I0G3 518 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa27.51■■□□□ 1.99
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SCAMP4-210ENST00000588555 PMF1Q6P1K2 205 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 XYLT1Q86Y38 959 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 C3orf20Q8ND61 904 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 C18orf8Q96DM3 657 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 TUBB2BQ9BVA1 445 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 IL23AQ9NPF7 189 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 ANAPC7Q9UJX3 599 aa27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 ALDH2P05091 517 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 GALTP07902 379 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 BST2Q10589 180 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 PEX26Q7Z412 305 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 MSANTD4Q8NCY6 345 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 STK32AQ8WU08 396 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 ALG6Q9Y672 507 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 MYBPHLA2RUH7 354 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAPPC3O43617 180 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 SRGAP2O75044 1071 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 TADA2AO75478 443 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 GJB6O95452 261 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 AMHP03971 560 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 MESDQ14696 234 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPROQ16827 1216 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 PKMYT1Q99640 499 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC4A5Q9BY07 1137 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 FAN1Q9Y2M0 1017 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 HYOU1Q9Y4L1 999 aa27.5■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 BAIAP3O94812 1187 aa27.49■■□□□ 1.99
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SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC24Q6P3W2 148 aa27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 OR10T2Q8NGX3 314 aa27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 HES6Q96HZ4 224 aa27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 OSBPL9Q96SU4 736 aa27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 COLEC11Q9BWP8 271 aa27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 B3GNT5Q9BYG0 378 aa27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR35Q9P2L0 1181 aa27.49■■□□□ 1.99
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SCAMP4-210ENST00000588555 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRSQ13332 1948 aa27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM110Q86TL2 294 aa27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 DUSP16Q9BY84 665 aa27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR62Q9BZJ7 368 aa27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4-210ENST00000588555 SYN3O14994 580 aa27.47■■□□□ 1.99
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