RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587721.1

RDH13-209, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 4

Gene RDH13, Length 731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-209ENST00000587721 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 DDR2Q16832 855 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GAB3Q8WWW8 586 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 HPS4Q9NQG7 708 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 EHD2Q9NZN4 543 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CCL26Q9Y258 94 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ZNF233A6NK53 670 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 AKAP3O75969 853 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SYT1P21579 422 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 IFNAR2P48551 515 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GPR15P49685 360 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 MTF1Q14872 753 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 WDR44Q5JSH3 913 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 IL31Q6EBC2 164 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 TTC16Q8NEE8 873 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ATP2A3Q93084 1043 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PANK2Q9BZ23 570 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 TSC2P49815 1807 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 RNF40O75150 1001 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 MAGEA11P43364 429 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GALK1P51570 392 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CASP5P51878 434 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 AMPD3Q01432 767 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 KCNB1Q14721 858 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SLC39A14Q15043 492 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 VSTM1Q6UX27 236 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 HPDLQ96IR7 371 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 TNMDQ9H2S6 317 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ECT2Q9H8V3 914 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 INTS13Q9NVM9 706 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CDH9Q9ULB4 789 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SCN1AP35498 2009 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GABRDO14764 452 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 AXIN1O15169 862 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ADRB1P08588 477 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ARSAP15289 507 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PFKLP17858 780 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 HDCP19113 662 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ANXA13P27216 316 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GJA4P35212 333 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 WNT7BP56706 349 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 RESTQ13127 1097 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 STK38Q15208 465 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PPM1JQ5JR12 505 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PDILTQ8N807 584 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CD101Q93033 1021 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ACDQ96AP0 544 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PKMYT1Q99640 499 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SYT15Q9BQS2 421 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 EGFP01133 1207 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ZNF806P0C7X5 589 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 GRIK1P39086 918 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PPP3CCP48454 512 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 PSMD2Q13200 908 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 FAM171BQ6P995 826 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 SYT13Q7L8C5 426 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 WDR49Q8IV35 697 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 STKLD1Q8NE28 680 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.71□□□□□ -0.05
RDH13-209ENST00000587721 CXorf38Q8TB03 319 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms