RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MCOLN2Q8IZK6 566 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R16BQ96T49 567 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM2Q99965 735 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 C9IYK1 514 aa26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRT35Q92764 455 aa26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-204ENST00000587718 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-204ENST00000587718 LTBRP36941 435 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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